Results for Project: Zhang_et_al_Arabidopsis (575f8bad7e9f)
(note: pri_sequences can be expanded by clicking on the entry)
| id | chr | start | stop | strand | energy | pri_sequence | star_sequence | mature_sequence | Secondary Structure |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| chr1_2536 | chr1 | 16939306 | 16939555 | + | -52.6 |
AGACGAACCTTAGAGGTCGCCGATTCGAGTGACGTTTGGGACGAAACTAATATTACATGCTGTGGTTTCGGGTCTGAGAGATTACGGGATTCGGTCCAGAACCTCCTAATATTTATAAAAAAAAAAATTTTTAAAATAAGAAATTAAAGCTCGGAACATTCAAACTCGTCTAATAGGTTGGAGAAAGCTGGTCAATCATCAGGCGAATACGCCACCGAGACTAAACTCTACACAATCAGTTTCAAATATC
|
TTCGGGTCTGAGAGATTACGGGATTC
|
TTCGAGTGACGTTTGGGACGAAAC
|
Show |
| chr1_2754 | chr1 | 17535381 | 17535630 | + | -89.5 |
TCCGGCTGGAGGTGGCGTCGTTGGCCAAACTGGTGGTGGCGTCGTTGGCCGAGCTGGTGGTGGCGTCGTTGGCCGAGCTGGTGGTGCGGCACGAGGCGCGATGGTTCTGACTCCTTGTTCGTTCGAGGTTTCCGTCATCTCGTCGTGGCTCTCCGGGATTACTGGCAACATCGTAGCTGCTCGTCAATATCAGAAGAAAACTCTGCCTAGCCCCACGGTGGGCGCCAATTGTTTGTACCGAGGTTGTAAC
|
GGCCAAACTGGTGGTGGC
|
CCCACGGTGGGCGCCAA
|
Show |
| chr1_6675 | chr1 | 17312257 | 17312504 | - | -51.0 |
TTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGGGTTATTACTTTGGTCGTGAGACAAACTTGGGCCGAATAATGCAATAGAATTCAAATTTCAAACCCAGAATCATACGCTCCCCAAACAGTGTCTTGTCGCTTTGATGTCTAAGGTTATACATGTAAAATTACATGTGTTTCCGACTTACCCCTGTAGCTCATGGCTATTCTCTTAATTTTTTTTGAATCCATGGCTATTTTATGTAGATACTCATTGAAATATGG
|
CTTGGGCCGAATAATGCAATA
|
GGGTTATTACTTTGGTCGTGAGAC
|
Show |
| chr1_7543 | chr1 | 13150249 | 13150496 | - | -50.3 |
TTAAAATATGGTGGTGGATGCGGTAATTGTAAAAGAAAATATTTGGTCATCTATGTCACCAAAGTATATTTATCTTTGGTTAAATATGCTGAGAGAACTCCACTGTTAAGCATATTTGGGCTGGAGTAACTTTAAAATAGTGACCTTCCAAAAAATGATTGTCGAAACTATGCGAATGAAGAGAAAGCATTAAGAAAGATCATCTGGTGATTTGTAGGGTCGGTAAACAACTCTTTAAAATATTTCGAAT
|
TAGTGACCTTCCAAAAAATGAT
|
CTGGTGATTTGTAGGGTCGGTAAA
|
Show |
| chr1_9366 | chr1 | 791952 | 792199 | - | -45.4 |
TAAATTAATATGACATTGTGAAATCTAACCGGATTTTGGATCCCGCCATTTAACCGTGGTCATTAGCGATTCCACAAATCCAACATGTTTTTCACATCTTCATATATATTTAGTTTAGTATTTTTTTACTTTCTTTTCTTAATAAGTATTCAACTCTTGCTTTTTGGATTTTTTTTTAAAAACGTTTTATAAGTACTAAATTAATATTACGTTGTGAAATCTAACCGGATTTTGGATCTCGCCATTTAAT
|
CCAACATGTTTTTCACATCTTCATA
|
TGACATTGTGAAATCTAACCGGAT
|
Show |
| chr2_1083 | chr2 | 3740732 | 3740981 | + | -135.2 |
ATCCGAGAGCTTTGTGGAATTCGACCCTTATGTGCTACAATCAATCTCTTATTTGAGACAGTGGTCTTAAGGCAATTTGACCTATATCAAATTTGGCACCGTTGCCGGGGATCGACCCGGGTCACCCGCGTGACAGGCGGGAATACTTACCACTTAGTACAACGACCCAATATAGTGGTAAGTATTCTCGCATGTCACTCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCAAATTTGATATAGCTCAAATCGCCT
|
GGCACCGTTGCCGGGGATCGA
|
GATCCCCGGCAACGGCGCCAA
|
Show |
| chr2_1956 | chr2 | 7193498 | 7193747 | + | -59.0 |
TAAAAAGTACCCAGGCTTATAAGCCCAAGTGAATTATGCTTTTATTCTAGTTTTTGGGTTAAAATATGCTCATATTTACAAAAGCCTCTTGTTACTTGCTATATAGCATAATGGATAAAGTGAAAGAAGGATAAAGATATCTTGTTTTATAGGGGAGCAATAGGTGCTTTTTGGCCCAAAAATTTGAAATTTAGCATTTTTACAATGGGCTAATAGAGTTAGGCATTTTCTATGAACTGAATTGACAAAA
|
GTACCCAGGCTTATAAGCCCAAGT
|
ATGGGCTAATAGAGTTAGGCATTT
|
Show |
| chr2_2911 | chr2 | 13031582 | 13031831 | + | -45.9 |
TAATTTTATTTTATACTATCTATAAAGTAACGTATGATTCGTCTATCACCAATTATCTTGTAAATGATGGTAAAATGTCTAAATTCGTTTGTCGCTTAATAATGATGATGATATACGTTACTTTAATTAAAAAAAGCGAATTTTCGATAGATACTCTATTAACTAAGCATGCACATATCACGTTGTGATTGATTTATGCCTAGTAAATAAAATTTATCTCCAGCAAGAATAATTGAAACTTCATAACTAA
|
ATGATGATATACGTTACTTTA
|
AAGTAACGTATGATTCGTCTATCA
|
Show |
| chr2_2912 | chr2 | 13031407 | 13031656 | + | -46.4 |
ATCAATAATAAGGTACTACTAGGGTTTTATTTCAATTAGGTTTGAATCTTGGGTCATTGTGACGAATAAATTATCTACTTGTCGATTTTCTACAAAAAGCACACATGAATTAGATTCAACGTGGCCAATTCATCTAACATATGTTACTAAAACAAGCGCAATAGACGAGTTGGCGTAATTTTATTTTATACTATCTATAAAGTAACGTATGATTCGTCTATCACCAATTATCTTGTAAATGATGGTAAAA
|
ATAGACGAGTTGGCGTAATTTTA
|
AAGTAACGTATGATTCGTCTATCA
|
Show |
| chr2_4527 | chr2 | 10621537 | 10621784 | - | -61.8 |
TTAGGCATATCGATAAATTTATGCTAACAAAAATATGACGGAGTTAACTTTTCGTAACGTTTGAAAAATAAATAAACCGTTAAAGAGAGAAACAAGCACAACATAGAGTTACAGAAAGTTTATAAGGTATTTTTCTAAATACATATAAGGGATTGTTCTAAACCAAACGTTACGGAAAATTAACTCCCTTATTTTTTTAGTCAACAAAAATTTAACAGTATGCCTAAAATGACTTAGTCAACAAAACTTA
|
ATTAACTCCCTTATTTTTTTAGTCA
|
ACAAAAATATGACGGAGTTAACTT
|
Show |
| chr2_4644 | chr2 | 10085767 | 10086014 | - | -65.8 |
TCTCTTTGGGGAATCTCGGCGGCGGTCTCGTCGACTGATGGAGGAATTTCGCCGGTCGATTCAACCCTAGTTGATTCATATTCTCCAGATGAGTCTTTTACTCTAGCCATTGGAAAATAAATTTGCGGATATGAAAGAGACAAAGACGAACGAAAACGGAGAAGAAAGAAGAATAGAAGAGATTGATTTTTCCGGTGAAAGTGGTATCGTCGGAGACGAGAGAAGACGACGACGGAGAGAAGAGGAAGAA
|
GCGGTCTCGTCGACTGATGGAG
|
TCGTCGGAGACGAGAGAAGAC
|
Show |
| chr2_4658 | chr2 | 9986351 | 9986598 | - | -65.5 |
AGGTCTCCAAAGTGAACAACCTTTGGTTGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAAAAGAGTAGGAGAAATCCAGATTAATAAATTCAATTTTCTATCAGGTCTTGATCAAGTGGCCAACACCAGGGCTGTGACCTGGTTCAGTAGACCGGAAAGCATTGAGACCATAAATATCCTTGCTCCTCCTCGTCTTGATGCTTCCTTGAAGCTCCTCTGGGGGAGTGTCCTTGTGATGGTGCTGCTGCTGCTGATGA
|
TCAATTTTCTATCAGGTCTTGAT
|
GGAACAATGTAGGCAAGGGAAA
|
Show |
| chr2_5547 | chr2 | 6227719 | 6227966 | - | -104.5 |
CTCAGCTACACCAAGTAGAAGGGAATACATGGGTCACACATGCTAAGTTTAGAAATGTACAACCAACTACACGAACTAAATTTATTGCATACCCACATATATCAACTATATGACGATATGTGGTCAACATCAACATCACGACATGTGGTCAATGCCGATCAACGATGGTCAACACCGGATTTCGTGATGTTGACCACATGTCGTCATATAGTTGGTATATGTGGGCATACAATACATCTAATTTGTGTAA
|
ATACCCACATATATCAACTATAT
|
ATAGTTGGTATATGTGGGCATAC
|
Show |
| chr2_6085 | chr2 | 4078172 | 4078419 | - | -62.0 |
CGATGATTCCTCCAAGAGCGAGTCAATGGATGAAAGAGTTGCCAATGTCAATAGACGAATGGGCGTTGATGAAAGGGTCAAAGGTGAGAAACTCGCCGGCACGAGAGTAACTACATGAGGTAGTGCTTTGAGATAGGTTCGAACAATGGTGAAGGTTTTCAGCTGCTTGCGTTTGCTTGCTAAAGTTTCATAGGAATGAGAGTTAAACTTGGGCCAAGCTGAGCAGAGGGAAACATTAAAGAGAATTTAT
|
GCTGCTTGCGTTTGCTTGCTAAAGTTTC
|
AACTTGGGCCAAGCTGAGCAGAGG
|
Show |
| chr2_6296 | chr2 | 2892203 | 2892301 | - | -22.7 |
GATATCCGCAGTTAAGCGTGTTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGCTGACCTCCCGGGAAGTCCTCGTGTTGCATCTCTCTTTTTTTTTTGGTTAAAACT
|
GAGAGTAGTACTAGGATGGC
|
AGTCCTCGTGTTGCATCTCTC
|
Show |
| chr2_680 | chr2 | 2063783 | 2064032 | + | -97.2 |
CTGCAAAACATTGGTATTATGGCTTCGAATGGTGACCAAACCGCACAGTGCGGTGCGTTTCAAATAGTAACGAAATTCTTTACATATACATGTGTATGTAAATATTTTTGTTACTATTTGAACCGCACCGCATTTTATCCGCAGTTGAATCGCACGTCTCCACTCGGAACCAATGAGTCTGAATGATGACTGCGTTTTGCGGTGCGGGAGAAGTGCGGTGCAGTTCAAATAGTAACGAAAATACATAGAT
|
GAACCGCACCGCATTTTATCCGC
|
GGGAGAAGTGCGGTGCAGTTCAA
|
Show |
| chr2_7032 | chr2 | 439560 | 439807 | - | -59.8 |
TATTTTAGAGGTGATTATATTTTAGAGGCATTGTGCACCAATAGTCACGTATAAAATAGAGTTTCCTCAAAAAGTAAACATCTCTATTTAAAAAAAAATATATCTCTATTTTTTTTTATAAGAAAACTTAATTTTAGAGATGATTATTAGAATACAATACCTCTAAAATAGAATCACCTTTAAAAATAAAGAAAAATATAGAAAGACCATTGAAAATACCCTAAGAAAATTAGGTCTCATATCATCATTG
|
GATTATTAGAATACAATACCTCTA
|
GAGGCATTGTGCACCAATAGTCAC
|
Show |
| chr3_1044 | chr3 | 9474785 | 9475034 | + | -46.0 |
ACTCTCGATTTGGTGATTTAAATCCTCAATTTTATGTTGACGTTTAATTTAATCACGAATTCTCGTTAACTAAGCCAATTAAGACACATCGTTAAAAAATTTTCTAATTAAAATTTTTGAGTTTTTCTCTATTTTTCTTCAGAATCTCTTATCTTCTTTGGAATTTCTCTTCTTATTCGAATTCAAAGTAATCTTTCATCTTTAGGTCGATTGACGATACCGGGAAAAAAAATTGTGTCTCAATTGGCTT
|
TTCTCTTCTTATTCGAATTC
|
GGTCGATTGACGATACCGGGAAAA
|
Show |
| chr3_1069 | chr3 | 9646379 | 9646628 | + | -49.7 |
TATTTCAAAAAATAATAATTAGAATTTAAAGTTAAAGCAAAGCTCCGACTTGAAATGCATATTGATGCTCATCAGGAAAAGTCATAAGACTTTTTCCTGCATTACCTTTTTCTTCTCTCAACATTGAACCAATTCGAAGGGTTTAGAGTTTATTATTATCAAGTTTCAACAAAGAGAGTGTTCAAAGTTTTTTTTTTTTAAATATCCTATCGGCTGATCCGGTCAGTTTTGGTAGGAACGCACCAAGGTG
|
TCAGTTTTGGTAGGAAC
|
TCCTATCGGCTGATC
|
Show |
| chr3_2159 | chr3 | 14196511 | 14196760 | + | -84.5 |
CCATGGGCATCGACACCTTGCGGCTAGGAACTGGAACGAGACGGGTGGCAAAGATTTCGAGTAGCACTTCATACTACCGTGGGTTTTTTAAACCTTCCCCTAGTTTTGTCGATGTTATTCCGAGAATTAGCAAACCGTAACGAAGATGTTCTTGGCAACCATCTTTTGATGGGAGTCCGGCTGTTCGATAGCCGGCCAAGGGTGATGAACGAAATGTGAACCCTTGTCTCGCCTAGGTTGGATGGGCGTG
|
CGTAACGAAGATGTTCTTGGCA
|
CTAGGAACTGGAACGAGACGGG
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